Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	579098	579441	344	28 [0]	[0] 20	[cspD]	[cspD]

TACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGCAC  >  minE/579045‑579097                                                     | tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:38937/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:950839/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:894879/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:727325/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:715105/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:700849/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:639848/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:576766/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:533553/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:501443/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:468051/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:457043/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:39649/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:119655/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:38555/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:267838/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:247383/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:228088/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:175909/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:1455897/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:1317350/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:1310490/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:1207582/53‑1 (MQ=255) tACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:1204649/53‑1 (MQ=255)  acacAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:490275/52‑1 (MQ=255)  acacAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:228926/52‑1 (MQ=255)        tGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:359747/46‑1 (MQ=255)                aagaGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGcac  <  1:169808/38‑1 (MQ=255)                                                     | TACACAATGAGACAGAAGAGCTATGCGACTGCCGCTTCTACTTCGACGGGCAC  >  minE/579045‑579097

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑