Missing coverage evidence...
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AGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAC  >  minE/582387‑582457                                                                       | aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTACCAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:883098/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:467429/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:962871/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:962512/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:944177/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:92113/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:808188/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:731404/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:626652/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:623778/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:558922/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:55416/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:539535/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:472703/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:1039340/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:456090/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:425650/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:38722/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:358898/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:216503/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:181991/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:1527791/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:1526634/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:14461/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:1433270/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:1373485/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:1351316/1‑71 (MQ=255) aGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAc  >  1:1154848/1‑71 (MQ=255)                                                                       | AGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTGCTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCAC  >  minE/582387‑582457

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑