Missing coverage evidence...
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GCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCT  >  minE/694225‑694293                                                                     | gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:596153/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1049067/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:36036/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:401520/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:402774/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:429584/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:519004/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:539584/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:546244/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:593002/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:17908/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:648727/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:664052/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:716969/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:836987/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:840537/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:941906/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:976210/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:995409/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1406856/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1086904/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1095268/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1097874/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1132753/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1137822/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1198013/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:128675/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1339773/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1350551/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1525228/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1420632/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1446803/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1452500/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1460922/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1498328/69‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1520760/69‑1 (MQ=255)  cAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:1414555/68‑1 (MQ=255)                             cgcAGCGGCTTAGCGAGGTATTTCAGTGGCTGGCGGAAGCt  <  1:269783/41‑1 (MQ=255)                                                                     | GCAGCGCCAGAAGATTTGGTCGACTCTGCGCAGCGGCTTAGCGAGGTATGTCAGTGGCTGGCGGAAGCT  >  minE/694225‑694293

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑