Missing coverage evidence...
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GCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAT  >  minE/722025‑722095                                                                       | gCAAAGGTTGCCAGCGCGGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1440269/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:603053/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:443223/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:477911/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:487701/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:494936/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:519967/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:522558/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:531308/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:57597/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:579812/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:58845/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:317195/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:72376/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:768069/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:795057/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:795361/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:798055/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:827992/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:838473/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:870070/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:877434/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:878825/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:965092/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1421990/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1027301/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1038426/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1053299/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1057977/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1156017/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1173028/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1212992/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1227501/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1322196/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1372448/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1397907/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:40315/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1434654/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1455629/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1549954/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:156954/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:164981/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:263543/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:273269/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:289004/1‑71 (MQ=255) gCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:1000331/1‑71 (MQ=255) gCAAAGCTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAt  >  1:2072/1‑71 (MQ=255)                                                                       | GCAAAGGTTGCCAGCGCAGGTTGTTCCGGACGCTTACGTTCAGCGAACTCTTCTTCAGACGGCAGCGCCAT  >  minE/722025‑722095

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑