Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	771762	771839	78	70 [0]	[0] 35	hflD	predicted lysogenization regulator

GCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAATAATA  >  minE/771691‑771761                                                                       | gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:45556/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1495899/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:169311/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:177557/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1049305/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:229500/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:285393/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:309441/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:326411/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:331521/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:333008/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:40209/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:405703/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:434588/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:438797/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:438932/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:22601/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:480147/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:621209/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:628637/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:68864/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:798278/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:801584/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:822526/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:827502/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:875213/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:887111/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:947650/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:950607/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:96367/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:970912/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1466717/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1071635/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1072376/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1096742/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1104782/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1115241/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1138799/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1142796/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1144522/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1152833/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1161299/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1207440/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:121393/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1245362/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1251337/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1333020/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1381648/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:147973/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1446976/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1427871/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:141530/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1381938/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1333918/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1369705/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:136935/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1361964/71‑1 (MQ=255) gCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1352454/71‑1 (MQ=255)  cccGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:767688/70‑1 (MQ=255)  cccGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:802427/70‑1 (MQ=255)  cccGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1409747/70‑1 (MQ=255)  cccGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1269774/70‑1 (MQ=255)  cccGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:181375/70‑1 (MQ=255)                  gCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:668921/54‑1 (MQ=255)                   cTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:314662/53‑1 (MQ=255)                    ttCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGGCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:726774/52‑1 (MQ=255)                       gCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:328144/49‑1 (MQ=255)                           ccGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:32422/45‑1 (MQ=255)                                caaaaCCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:1282838/39‑1 (MQ=255)                                   aaCCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAataata  <  1:940401/37‑1 (MQ=255)                                                                       | GCCCGACGCGCAGGTTGGCTTCGCTACCGCCAAAAACCGCCAGCGTCGAGCTGGGGTTCATATCAATAATA  >  minE/771691‑771761

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑