Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	794266	794294	29	75 [0]	[0] 10	[cvrA]	[cvrA]

CAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTA  >  minE/794195‑794265                                                                       | cAAGACGGGAATAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGTCAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:463204/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAATAGGCTa  <  1:3518/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:406493/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:612574/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:569922/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:52148/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:47457/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:449345/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:425934/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:424097/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:655615/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:389267/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:379528/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:37844/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:372840/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:369053/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:355977/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:341019/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:834983/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1027311/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:992125/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:983736/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:982667/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:978883/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:936243/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:933373/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:864443/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:994463/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:827043/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:805224/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:79283/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:788877/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:732162/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:722100/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:66329/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1301355/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1432732/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1429960/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:324255/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1369412/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1354561/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1335694/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1334377/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1318230/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1373413/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1285901/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1226979/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1198152/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:119743/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1129514/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1108093/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1034957/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:236723/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:320085/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:313854/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:29701/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:28576/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:25466/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:250127/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1435588/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:161648/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1559989/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1557303/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1480944/71‑1 (MQ=255) cAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1446806/71‑1 (MQ=255)   aGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:174895/69‑1 (MQ=255)        ggAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:452329/64‑1 (MQ=255)        ggAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:308625/64‑1 (MQ=255)         gaagaaAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:890459/63‑1 (MQ=255)         gaagaaAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1206400/63‑1 (MQ=255)           agaaAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1216310/61‑1 (MQ=255)                    aCTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:82428/52‑1 (MQ=255)                       aaGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:412511/49‑1 (MQ=255)                        aGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:86064/48‑1 (MQ=255)                           aaTATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTa  <  1:1344337/45‑1 (MQ=255)                                                                       | CAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGACAAGGATGGATCCTAAGATGAAAAGGCTA  >  minE/794195‑794265

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑