Missing coverage evidence...
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ATCTCATCAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGTT  >  minE/940477‑940523                                               | atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:88431/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1000137/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:564800/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:583048/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:613504/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:716023/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:755250/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:807608/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:883118/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:506340/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:894407/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:911924/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:914936/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:91533/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:919998/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:937298/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:974310/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:208967/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1007103/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1060541/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1100680/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1126728/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1137105/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1161298/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1163857/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:123620/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:124971/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1322805/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1326063/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1377168/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1408056/47‑1 (MQ=255) atctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:448749/47‑1 (MQ=255)  tctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:663988/46‑1 (MQ=255)  tctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:595785/46‑1 (MQ=255)  tctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:1113234/46‑1 (MQ=255)   ctcatcAATATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGtt  <  1:100298/45‑1 (MQ=255)                                               | ATCTCATCAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGTT  >  minE/940477‑940523

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑