Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1069483	1069817	335	75 [0]	[0] 25	cfa	cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase

TAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGT  >  minE/1069427‑1069482                                                        | tAAAAAACGTGCGTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:345308/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:636026/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:691719/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:610926/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:607425/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:601572/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:583681/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:578281/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:551982/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:520667/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:455278/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:440864/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:413536/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:396193/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:393626/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:380762/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:380141/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:3585/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:346879/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:842232/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1029810/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:961847/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:926858/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:896921/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:887927/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:87894/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:878187/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:849601/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:965636/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:840251/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:807943/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:806416/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:782184/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:777854/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:739644/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:722811/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:694356/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1168701/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1288742/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1285465/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1271480/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:12430/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1225128/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1216442/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1188233/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1175619/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:32049/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1165756/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1159972/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1122846/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1121633/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1083112/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1061285/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1059120/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1049735/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1446975/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:321341/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:213869/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:17374/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:164727/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:156024/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1544613/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1504615/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:146856/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1344535/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1443441/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:141607/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1415923/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1400840/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:136016/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1346725/56‑1 (MQ=255) tAAAAAACGTGCCTCGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1372668/56‑1 (MQ=255)         gTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:920825/48‑1 (MQ=255)              tGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:468483/43‑1 (MQ=255)                  tAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGt  <  1:1326932/39‑1 (MQ=255)                                                        | TAAAAAACGTGCCTGGATAGTCGGCAAAGAGCATTACGATTTGGGTAATGACTTGT  >  minE/1069427‑1069482

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑