Missing coverage evidence...
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CCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGTT  >  minE/1079333‑1079403                                                                       | cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:497764/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:200096/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:206849/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:207303/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:232982/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:300994/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:332195/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:365890/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:366875/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:445751/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:490411/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:194093/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:524242/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:552114/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:637253/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:667343/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:690167/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:75995/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:778449/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:889141/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:909973/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1307204/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1035532/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:106246/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1094983/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1161360/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:119022/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1191948/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1228063/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1289956/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1301061/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1015341/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:134337/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1343460/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1374214/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1441150/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1452290/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1465380/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1494222/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGtt  >  1:1502134/1‑71 (MQ=255) cccTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTAATCCTGATGGtt  >  1:1484037/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAACTTCGCTGACTTTCGCTAACGGCAATTCATCCTGATGGTT  >  minE/1079333‑1079403

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑