Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1149962	1150454	493	72 [0]	[0] 123	[nadE]	[nadE]

CGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTG  >  minE/1149891‑1149961                                                                       | cGCCAGCATGGTTAATACCTCCGCTTCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:834788/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTGCGTCCTCTTg  <  1:709989/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:400635/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:657724/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:653105/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:629052/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:500507/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:487539/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:475658/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:441468/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:682669/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:398894/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:350728/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:336325/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:322176/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:315961/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:285340/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:283400/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1039064/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:85593/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:984242/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:980028/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:979311/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:912191/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:911414/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:885985/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:885595/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:880411/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:674005/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:855457/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:789839/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:776316/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:766738/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:719821/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:685823/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:278816/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1204955/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:130639/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:129447/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1287321/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1287151/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1277372/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1233491/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1209715/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:120883/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:134306/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:119165/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1182950/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1176260/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1172019/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1140497/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1129956/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1109532/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1508771/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:248466/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:235642/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:228492/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:223281/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:218313/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:214970/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:201255/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:15812/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1545934/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1373957/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1465057/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1461038/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1459818/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1415794/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1411809/71‑1 (MQ=255) cGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:1379197/71‑1 (MQ=255)              aaTACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:265894/58‑1 (MQ=255)                                   aTTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTg  <  1:797469/37‑1 (MQ=255)                                                                       | CGCCAGCATGGTTAATACCGCCGCTGCACTCAGAATTCCTGCCATATTCTTGTTCATATTCCGTCCTCTTG  >  minE/1149891‑1149961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑