Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1177554	1177781	228	89 [0]	[0] 65	sppA	protease IV

AAACGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAA  >  minE/1177483‑1177553                                                                       | aaccGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGGCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:483038/68‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTCTGGATGGCGAGGaa  <  1:965720/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:635564/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:272787/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:556485/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:556451/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:549589/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:49615/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:49310/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:478548/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:452168/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:432948/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:368510/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:367575/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:365415/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:352866/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:346965/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:346679/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:331889/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:320348/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:303270/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:277329/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:825689/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:950805/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:934061/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:930833/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:91420/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:905590/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:905110/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:904069/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:877114/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:857675/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:849639/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:640904/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:812526/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:803488/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:786812/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:75365/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:742823/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:737291/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:720572/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:679754/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:677640/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1120855/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1203794/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:250806/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1188095/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1184571/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:116263/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1148508/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1135030/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1128021/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1126059/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1125804/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1234421/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1118764/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1108350/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1011543/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1101507/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1095939/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1058054/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1038571/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1024126/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1012982/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1011344/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1006428/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:248484/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:194260/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:191381/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:176608/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:175728/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1523748/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1506106/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1474063/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1450087/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1414636/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1412446/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1407295/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1398738/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1386518/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1361470/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1293023/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1273955/71‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1264444/71‑1 (MQ=255)  aaCGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1185010/70‑1 (MQ=255)       cGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:668403/65‑1 (MQ=255)                 cGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:1005253/55‑1 (MQ=255)                    tGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:382149/52‑1 (MQ=255)                              ggTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGaa  <  1:870617/42‑1 (MQ=255)                                                                       | AAACGCCGGCAGATACCGGTGACAGCATCGGTGTCGTCTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAA  >  minE/1177483‑1177553

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑