Missing coverage evidence...
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ACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGACAC  >  minE/1179294‑1179364                                                                       | acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCCGCGATCGCGGTATTGTGGTGGGCAACCTGacac  <  1:24303/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:575236/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:963538/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:863389/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:852382/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:845084/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:7515/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:1044759/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:546644/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:497646/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:297746/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:249301/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:171756/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:1463191/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:1214672/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:1089955/71‑1 (MQ=255) acaaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGGCAACCTGacac  <  1:780916/71‑1 (MQ=255)  caaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:636738/70‑1 (MQ=255)  caaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:712124/70‑1 (MQ=255)  caaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:748329/70‑1 (MQ=255)  caaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:1325157/70‑1 (MQ=255)  caaaacaaaGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGGCAACCTGacac  <  1:822274/70‑1 (MQ=255)           gCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:1245360/61‑1 (MQ=255)                                  agCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:758171/38‑1 (MQ=255)                                     cAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGacac  <  1:710279/35‑1 (MQ=255)                                                                       | ACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGACAC  >  minE/1179294‑1179364

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑