Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1179764	1180051	288	12 [5]	[0] 95	[gapA]	[gapA]

TTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGG  >  minE/1179694‑1179764                                                                      |  tttATCGTAATTGCCCTTTAAATTTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAgg  >  1:544918/1‑71 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAgg  >  1:1427979/1‑71 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAgg  >  1:315152/1‑71 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAgg  >  1:335273/1‑71 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAgg  >  1:716521/1‑71 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAg   >  1:1191323/1‑70 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAg   >  1:283738/1‑70 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAg   >  1:350199/1‑70 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAg   >  1:459006/1‑70 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAg   >  1:503531/1‑70 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAg   >  1:696702/1‑70 (MQ=255) tttATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAg   >  1:726499/1‑70 (MQ=255)                                                                      |  TTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGG  >  minE/1179694‑1179764

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑