Missing coverage evidence...
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AATAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTG  >  minE/1190630‑1190699                                                                      | aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1376214/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:945249/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:84845/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:733001/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:677781/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:669454/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:662122/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:602723/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:571763/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:564611/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:504248/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:445932/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:404251/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:282598/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1546251/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1459931/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1000716/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1367315/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1337456/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:132221/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:13134/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:122831/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1221686/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1212202/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1201205/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1144868/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1122749/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1034306/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1016723/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1011803/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1001209/1‑70 (MQ=255) aaTAAGCAGAACAAAAACAGACGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTg  >  1:1036184/1‑70 (MQ=255)                                                                      | AATAAGCAGAACAAAAACAGCCGTTCATGATAACCTTCTGTGGTTGTTTGCTTGTAATCTCAGGAGCGTG  >  minE/1190630‑1190699

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑