Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 55881 55896 16 87 [0] [0] 77 djlA/yabP DnaJ‑like protein, membrane anchored/hypothetical protein

ATTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAC  >  minE/55810‑55880
                                                                      |
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGGTAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1489086/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:537848/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:731038/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:727819/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:72621/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:721780/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:715747/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:699246/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:68060/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:67577/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:660917/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:733070/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:53304/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:52761/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:485051/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:466148/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:440784/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:405120/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:369698/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1030563/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:313140/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:857137/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:999536/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:995440/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:988079/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:987779/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:92317/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:922224/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:89604/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:861625/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:860258/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:350569/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:855391/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:851618/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:850831/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:841151/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:835554/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:815448/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:813300/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:81014/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:798514/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1227259/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:144934/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1444733/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:294538/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1354451/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1330814/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1248794/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1244135/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1231524/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1228131/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1359748/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1219590/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1204763/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1159324/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1126159/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1123682/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1116683/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1115781/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1113606/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1103847/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:172746/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:279987/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:261655/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:22626/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:213062/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:20705/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:196264/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:191855/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:189068/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:185827/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1451613/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:152383/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1508679/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1501446/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1474981/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1454043/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGAACCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1267601/71‑1 (MQ=255)
aTTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTCAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1247881/71‑1 (MQ=255)
 ttCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:823238/70‑1 (MQ=255)
 ttCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:810971/70‑1 (MQ=255)
 ttCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:780089/70‑1 (MQ=255)
  tctgcagGCATATGAGCTGATAAAGCAGCTGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:969204/66‑1 (MQ=255)
     gcagGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:1488394/66‑1 (MQ=255)
           atatGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:825419/60‑1 (MQ=255)
               gAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:538507/56‑1 (MQ=255)
                   tGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAc  <  1:267394/52‑1 (MQ=255)
                                                                      |
ATTCAGCAGGCATATGAGCTGATAAAGCAGCAGAAAGGGTTTAAATGACCCTGTAAATGATGCTGAGTAAC  >  minE/55810‑55880

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: