Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1324112	1324640	529	67 [0]	[0] 15	[wcaM]–[wcaL]	[wcaM],[wcaL]

TTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCA  >  minE/1324062‑1324111                                                  | tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGTCGCTCa  <  1:131/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:596151/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:701642/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:683443/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:669112/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:656546/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:642802/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:625560/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:604624/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:724238/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:573768/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:556153/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:550914/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:51443/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:497842/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:481932/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:363256/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:706329/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:352621/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:733779/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:782131/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:8044/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:816142/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:883001/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:896538/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:905848/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:908800/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:916219/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:931503/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:967632/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:969802/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:976308/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:999947/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:137030/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1048357/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1070153/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1126765/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1127493/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1144715/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1145375/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1152802/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1209907/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1217430/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1221382/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1258269/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1290379/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1309726/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1325956/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1012815/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:253140/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:31534/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:310072/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:298440/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:295448/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:283722/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:260603/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1430389/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:191724/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:188340/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1535216/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1502657/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1458313/50‑1 (MQ=255) tttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:143309/50‑1 (MQ=255)  ttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1182532/49‑1 (MQ=255)  ttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:1561962/49‑1 (MQ=255)     tttttGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:557792/46‑1 (MQ=255)           ccgccgATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCa  <  1:765181/40‑1 (MQ=255)                                                  | TTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCA  >  minE/1324062‑1324111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑