Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1329600	1330255	656	93 [0]	[0] 98	[wcaJ]–[cpsG]	[wcaJ],[cpsG]

GCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTC  >  minE/1329529‑1329599                                                                       | gcgTTATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:602172/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCGGTc  >  1:1308733/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:493638/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:573132/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:556435/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:554035/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:5468/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:528819/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:513291/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:508097/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:506612/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:505254/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:49608/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:256268/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:451394/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:439286/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:434528/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:405527/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:39388/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:382252/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:36040/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:346883/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:281787/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:259773/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:252919/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:87259/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:990255/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:967587/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:960107/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:95032/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:937434/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:930879/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:92677/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:921148/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:885456/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:87742/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:601580/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:864922/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:849282/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:818939/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:793559/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:793200/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:789362/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:763657/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:718761/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:687048/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:679758/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1154620/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1008483/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1310192/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1281735/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1256586/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1249862/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1226084/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1214650/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1184509/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1175142/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1166880/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1166783/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1365301/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1125735/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1120013/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1114548/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1114094/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1099736/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1075889/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:105326/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1041716/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1029214/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1021448/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1488965/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:230124/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:210656/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:161004/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:157611/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:156689/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1561385/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:15533/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1530399/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1514070/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1372493/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1471519/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1467492/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1467072/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1445768/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1442515/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1398571/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1392306/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1388881/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:1381698/1‑71 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACACGCCCAGTc  >  1:1340992/1‑71 (MQ=255) gcgATAGAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGCCCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:202279/1‑71 (MQ=255) acgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc  >  1:453607/2‑71 (MQ=255)                                                                       | GCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTC  >  minE/1329529‑1329599

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑