Missing coverage evidence...
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AACCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTCC  >  minE/1338130‑1338170                                         | aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:280302/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:822439/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:734462/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:702582/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:630617/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:540978/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:410443/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:306460/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:111604/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:186254/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:1494139/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:1474274/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:1252383/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:1235463/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:1142316/41‑1 (MQ=255) aaCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:1137544/41‑1 (MQ=255)  aCCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTcc  <  1:294369/40‑1 (MQ=255)                                         | AACCGCCATCGACAACAATCCATTCGAAGCTGATATCTTCC  >  minE/1338130‑1338170

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑