Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1353276	1353374	99	72 [0]	[0] 57	thiM	hydoxyethylthiazole kinase

ACCGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTG  >  minE/1353205‑1353275                                                                       | accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCATCACGCATCGCCTg  <  1:580099/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:311509/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:551513/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:539360/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:495951/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:46963/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:434475/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:39419/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:319938/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:561809/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:283796/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:274573/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:242671/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:227143/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:223272/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:193998/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1536435/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:152545/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1009232/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:597090/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:605933/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:618100/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:631937/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:638440/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:640283/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:648029/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:68255/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:751090/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:809502/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:820802/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:864412/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:87548/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:893198/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:937978/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1203539/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1273083/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1255175/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1253566/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1253505/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:124113/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1238514/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1232241/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1216666/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1504139/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1185757/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:115231/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1140202/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1092779/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:106013/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1056889/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1028486/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1001019/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1307933/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1516162/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1496577/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1480037/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1466283/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1461821/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1450414/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1441245/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:141006/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:140102/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1372473/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1363068/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1349213/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1343899/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1342917/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:1305454/71‑1 (MQ=255) accGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACAGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:854946/71‑1 (MQ=255)  ccGCTAGTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:469227/70‑1 (MQ=255)  ccGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:969608/70‑1 (MQ=255)             tCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTg  <  1:797402/59‑1 (MQ=255)                                                                       | ACCGCTACTGGATCAAGCGTCCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTG  >  minE/1353205‑1353275

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑