Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1440345	1440950	606	81 [0]	[0] 52	ompC/rcsD	outer membrane porin protein C/phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGC  >  minE/1440286‑1440344                                                           | gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:419084/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:571848/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:540060/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:536900/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:532361/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:510625/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:500824/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:470487/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:467645/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:455121/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:444029/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:578153/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:399417/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:391412/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:375321/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:367526/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:364201/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:346627/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:311478/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:308693/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:299170/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:908307/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:995320/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:989469/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:969022/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:956257/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:952390/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:950539/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:927593/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:915902/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:912812/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:29774/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:884046/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:802671/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:784260/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:726159/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:654264/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:65340/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:643598/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:635362/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:593151/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1339480/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1468348/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1462975/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1447607/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1444044/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:143881/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1401718/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1368796/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1350742/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1349460/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1487425/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1231780/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1214013/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1200371/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1175942/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1160026/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1061436/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1040745/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1037663/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1019731/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:206931/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:281088/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:277550/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:263145/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:254171/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:252437/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:25030/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:244500/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:226478/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:221580/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1016093/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:184551/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1542142/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1539946/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:153972/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1525157/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1518999/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1513039/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1495029/1‑59 (MQ=255) gTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGc  >  1:1494613/1‑59 (MQ=255)                                                           | GTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCCTCTGTTATATGCCTTTATTTGCTTTTTTATGC  >  minE/1440286‑1440344

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑