Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1440993	1441003	11	53 [0]	[0] 108	ompC/rcsD	outer membrane porin protein C/phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

TCATCAATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTT  >  minE/1440951‑1440992                                          | tcatcaCTCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:463950/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTGACACTGTACCCtt  <  1:908659/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCttt  <  1:1271978/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:561156/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:375055/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:379663/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:407502/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:409826/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:416056/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:460813/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:478797/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:482666/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:482810/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:49168/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:524035/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:555400/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:363791/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:572105/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:704862/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:718531/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:738084/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:74386/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:754714/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:872525/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:895427/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:90819/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:99402/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1340321/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1024763/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1111101/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1126924/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1144967/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1153326/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1158371/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1211077/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1224587/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1228073/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1261489/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1269571/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1014415/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1376466/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1401312/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1414350/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1427293/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1496551/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1497234/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1510510/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:153580/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:1551509/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:239048/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:278303/42‑1 (MQ=255) tcatcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:346984/42‑1 (MQ=255)  catcaATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCtt  <  1:884727/41‑1 (MQ=255)                                          | TCATCAATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTT  >  minE/1440951‑1440992

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑