Missing coverage evidence...
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AATCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAT  >  minE/1496373‑1496443                                                                       | aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGCCCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1281166/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGCCCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1504427/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1512106/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:930263/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:924087/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:639520/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:589610/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:544485/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:510943/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:434394/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:414099/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:370130/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:349143/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:276351/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:248166/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:215434/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1010057/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1363648/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1333966/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1268342/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1233832/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1233559/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1178208/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1169116/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1109948/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1047594/1‑71 (MQ=255) aaTCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCGCCAGCGCACGCAGAAt  >  1:1376347/1‑71 (MQ=255)                                                                       | AATCGACACAGTTGCTCAAGTGTTTCGATATCGCCCGGCTGACCTTCACCACGCTCCAGCGCACGCAGAAT  >  minE/1496373‑1496443

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑