Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1528142	1528229	88	47 [0]	[0] 8	trmC	fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme

CGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAC  >  minE/1528107‑1528141                                   | cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:685427/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:414646/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:426194/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:440001/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:446776/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:487614/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:536302/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:612797/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:660357/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:66564/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:674070/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:679833/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:368231/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:687210/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:695099/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:757784/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:858719/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:862405/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:86679/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:877460/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:881535/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:890906/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:931838/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:932201/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1543169/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:105753/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1092970/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1158231/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1182916/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1233873/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1282369/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1412365/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1448207/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1492257/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1508298/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1005639/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:170927/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:187151/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:210554/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:22783/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:22960/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:251204/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:26514/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:317888/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:333487/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTTGTCAAAGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:1274861/1‑35 (MQ=255) cGCACAGATGTAGTCAATGGATTTACCCGCAGAAc  >  1:204506/1‑35 (MQ=255)                                   | CGCACAGATGTTGTCAATGGATTTACCCGCAGAAC  >  minE/1528107‑1528141

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑