Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1540977	1541021	45	24 [0]	[0] 80	yfcV/sixA	predicted fimbrial‑like adhesin protein/phosphohistidine phosphatase

CTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATACC  >  minE/1540907‑1540976                                                                      | cgtAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACAGTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1440516/3‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCGGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1170795/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:313002/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:943934/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:942083/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:933821/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:894167/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:829706/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:769569/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:73707/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:598170/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:53892/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:535128/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:418561/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1094165/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:289936/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:165799/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1448814/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1443837/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1407975/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1397554/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1271471/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:112960/1‑70 (MQ=255) cTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATAcc  >  1:1108136/1‑70 (MQ=255)                                                                      | CTTAAACTATAAATAATTAAAATATAAACATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATACC  >  minE/1540907‑1540976

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑