Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1557161	1557560	400	13 [0]	[4] 31	[emrY]	[emrY]

CGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTAA  >  minE/1557092‑1557160                                                                     | cGAGTTGACCCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:1201936/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:1085263/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:1126641/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:1488440/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:395927/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:418405/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:573888/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:586989/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:591603/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:723915/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:83080/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:877477/1‑69 (MQ=255) cGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTaa  >  1:984086/1‑69 (MQ=255)                                                                     | CGAGTTGAACCAATCCAGATCGCGCCCTTTATCAAGCATAATTTGCAAGCCACCAACACCGAGCACTAA  >  minE/1557092‑1557160

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑