Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1559943	1560088	146	52 [0]	[0] 33	[evgA]–[evgS]	[evgA],[evgS]

AAACTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAT  >  minE/1559892‑1559942                                                   | aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:663496/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:382977/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:394116/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:418261/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:418316/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:434374/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:434899/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:437718/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:464896/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:57525/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:63299/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:640129/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:657024/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1014521/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:701853/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:755861/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:756978/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:802797/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:843041/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:922915/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:939419/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:945940/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:960296/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:968532/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:975615/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:361843/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1001469/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1044454/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:107924/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1090597/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1094754/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1161039/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1175242/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1287314/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1335960/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1338541/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1411815/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1451706/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1485789/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1514590/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1520480/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1520870/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:1560313/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:189795/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:191389/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:214004/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:273661/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:334016/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:375436/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAAAGTAAAt  <  1:238014/51‑1 (MQ=255) aaaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATCAGAATGTAAAt  <  1:985148/51‑1 (MQ=255)  aaCTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAt  <  1:563468/50‑1 (MQ=255)                                                   | AAACTGTCAGCACTTATAAAAGTCGCCTGATGGAAAAATTAGAATGTAAAT  >  minE/1559892‑1559942

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑