Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1561101 1562028 928 23 [0] [0] 9 evgS hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

TCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCT  >  minE/1561030‑1561100
                                                                      |
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1552324/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:901022/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:882995/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:832487/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:76269/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:753645/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:630231/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:525378/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:280468/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:213079/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1004244/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:149498/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:141169/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1339785/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1261971/71‑1 (MQ=255)
tCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1171796/71‑1 (MQ=255)
  aCCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:131263/69‑1 (MQ=255)
   gcGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1513004/67‑1 (MQ=255)
     gTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:323381/66‑1 (MQ=255)
         cacacaATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1111649/62‑1 (MQ=255)
          acacaATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:406039/61‑1 (MQ=255)
                tatCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1296001/55‑1 (MQ=255)
                                 aGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCt  <  1:1070133/38‑1 (MQ=255)
                                                                      |
TCACCGTTTCACACAATATCCATGCTGGAACACAGCTTAGCCCCGGAGGATGGGATATAATACCTGGCGCT  >  minE/1561030‑1561100

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: