Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1562508	1562616	109	54 [0]	[0] 46	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

CGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGT  >  minE/1562437‑1562507                                                                       | cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:545834/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:903250/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:377429/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1052193/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:401014/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:404419/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:405878/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:457475/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:467842/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:50922/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:52843/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:541015/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:359136/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:551599/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:629734/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:647618/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:672887/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:709300/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:7158/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:801054/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:877150/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:887511/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:892783/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1380400/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:959842/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1080672/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1102155/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:112647/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1227248/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1303442/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1307108/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1341702/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1357836/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1370585/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:931170/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1411375/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1426088/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1513146/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1514394/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1549745/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1559842/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:158679/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:168948/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:174544/71‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:219370/71‑1 (MQ=255)  gTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1446310/70‑1 (MQ=255)  gTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:747764/70‑1 (MQ=255)         gAACATTACCTGGATAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:850615/63‑1 (MQ=255)             aTTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:43036/59‑1 (MQ=255)              ttACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:675000/58‑1 (MQ=255)                 ccTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAATTTTACTGAGt  <  1:395193/55‑1 (MQ=255)                    ggTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:1079251/52‑1 (MQ=255)                          gttCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:348329/44‑1 (MQ=255)                                    cAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt  <  1:341150/36‑1 (MQ=255)                                                                       | CGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGT  >  minE/1562437‑1562507

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑