Missing coverage evidence...
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CACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTGCATGGGT  >  minE/1570476‑1570553                                                                       |        cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:359010/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:997682/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:931990/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:878897/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:869040/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:835471/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:82682/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:734556/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:670796/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:650634/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:635278/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:58682/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:569327/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:566752/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:496460/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:472766/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1023838/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:272797/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:25788/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:177476/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1493425/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1464986/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1441897/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1438038/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1312467/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1299388/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1206651/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1189523/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1156249/71‑1 (MQ=255) cACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTg         <  1:1101490/71‑1 (MQ=255)                           gCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTGCatgggt  <  1:1333015/52‑1 (MQ=255)                           gCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTGCatgggt  <  1:1253493/52‑1 (MQ=255)                                                                       |        CACCGTTACTGGCTGGTTTGGCTACAGCATCTCCTTCCAGGGCATCCTGGGCTACATCTTCTATCCGATTGCATGGGT  >  minE/1570476‑1570553

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑