Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1685142	1685747	606	52 [0]	[0] 133	[sseA]	[sseA]

AATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCC  >  minE/1685071‑1685141                                                                       | aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTGTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1372527/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:808964/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:323879/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:332083/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:348046/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:39092/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:472387/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:501173/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:510003/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:515793/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:631503/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:775516/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:803779/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:273457/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:846440/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:85032/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:854349/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:871738/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:912116/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:937193/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:954820/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:972563/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:975178/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:990746/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:995776/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:999076/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1330226/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:101452/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1020181/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1030048/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1116828/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1149919/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:122318/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1246958/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1248779/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1272834/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1281593/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1317983/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:100668/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1351781/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1384565/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1389656/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:139740/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1471975/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1528568/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1529007/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:1540705/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:169978/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:175656/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:200851/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:233988/1‑71 (MQ=255) aaTTTTAGTGAGAATTGAGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc  >  1:991119/1‑71 (MQ=255)                                                                       | AATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCC  >  minE/1685071‑1685141

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑