Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1701376 1702170 795 120 [0] [0] 64 [hcaR]–[hcaE] [hcaR],[hcaE]

Only 100 of 120 total aligned reads displayed.

GTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGC  >  minE/1701305‑1701375
                                                                      |
gatAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1187592/3‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCGTTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:489763/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:41052/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:533373/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:501508/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:487600/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:482347/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:473547/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:463862/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:458765/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:454351/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:447285/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:433289/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:553981/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:404843/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:392498/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:390348/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:38237/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:373470/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:363325/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:358006/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:317627/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:308076/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:30718/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:285295/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:26692/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:725323/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:977025/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:965201/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:964298/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:932206/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:882753/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:864175/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:860435/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:806287/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:803168/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:769673/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:732954/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:731734/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:552264/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:703388/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:702915/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:669313/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:662304/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:63798/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:634877/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:62303/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:594910/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:592634/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:565359/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:263981/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1137928/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1296305/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1286893/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1286548/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:127363/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1272949/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1271030/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1240205/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1214058/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:120404/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1185442/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1162414/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1159543/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1351902/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:110505/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1103792/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1079109/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1075268/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1073439/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1072410/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:107017/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1045515/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1035638/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1021697/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1017627/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1543667/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:221167/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:21377/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:196807/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:190975/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:190835/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:183299/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:173714/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:161407/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1562020/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1559491/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1555112/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:10069/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1486689/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1476011/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1468308/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1457983/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1457072/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1435098/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1407399/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1400533/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1372956/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:1358863/1‑71 (MQ=255)
gTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGc  >  1:135647/1‑71 (MQ=255)
                                                                      |
GTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGCTTGTTCGAGGATTGC  >  minE/1701305‑1701375

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑