Missing coverage evidence...
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GTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAG  >  minE/103512‑103582                                                                       | gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:221169/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:945735/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:891086/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:839739/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:810411/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:705752/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:604537/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:578312/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:468035/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:429518/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:292301/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:282594/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1008596/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:162708/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1547472/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1483771/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1321124/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1284711/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:112972/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1036896/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1015955/71‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1014739/71‑1 (MQ=255)  ttCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACACTATTAg  <  1:1444/70‑1 (MQ=255)  ttCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:267234/70‑1 (MQ=255)  ttCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1431265/70‑1 (MQ=255)  ttCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1329741/70‑1 (MQ=255)  ttCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1262367/70‑1 (MQ=255)  ttCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:808539/70‑1 (MQ=255)  ttCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:816453/70‑1 (MQ=255)                         cgccCGGATGACGAAACACCGACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAg  <  1:1073088/47‑1 (MQ=255)                                                                       | GTTCCCTCACCACATTACGATTGCCGCCCGGATGACGAAACACCCACCCTGCTGGTGGTGCACAATATTAG  >  minE/103512‑103582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑