Missing coverage evidence...
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TATTTCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGAAA  >  minE/1863773‑1863842                                                                      | tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:57729/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:166498/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1004564/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:377988/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:403864/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:486769/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:528534/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:546832/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:552491/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:576411/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:338872/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:598478/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:721207/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:74768/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:792805/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:810602/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:825657/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:890918/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:973051/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:976057/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1251747/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1039220/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1059401/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1064080/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1101104/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1104458/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1148142/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1238716/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1554780/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1290792/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1296434/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1302175/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1306131/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1312559/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1385812/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:141995/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1454041/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1545009/70‑1 (MQ=255) tatttCCGTGTTGTACGGAAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:866535/70‑1 (MQ=255)  atttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:932051/69‑1 (MQ=255)   tttCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1264611/68‑1 (MQ=255)         tgttgtACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:709672/62‑1 (MQ=255)         tgttgtACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:401344/62‑1 (MQ=255)                     atatCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGaaa  <  1:1145559/50‑1 (MQ=255)                                                                      | TATTTCCGTGTTGTACGGCAATATCTGCACCATCAGTAATATCGTTAAAAAGATTAAGAACGCCGGGAAA  >  minE/1863773‑1863842

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑