Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1882533	1882972	440	30 [0]	[0] 123	relA	(p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase

TTCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGT  >  minE/1882494‑1882532                                       | ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:44107/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:975967/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:952472/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:920618/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:815956/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:737128/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:718694/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:697383/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:681477/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:667885/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:665260/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:663390/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:632763/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:626701/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:454701/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:1190891/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:417220/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:416494/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:395917/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:363745/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:286738/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:262434/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:241521/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:1542841/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:1525775/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:1410367/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:1400130/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:1340751/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:1321537/39‑1 (MQ=255) ttCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGt  <  1:1297397/39‑1 (MQ=255)                                       | TTCGTTTGTATTCGGTTGGATGGAGGTAACGGAAGCAGT  >  minE/1882494‑1882532

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑