Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1941936	1941997	62	54 [0]	[0] 42	yqfA	predicted oxidoreductase, inner membrane subunit

TCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTAA  >  minE/1941870‑1941935                                                                  | tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:788784/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:400701/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:405454/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:410227/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:431952/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:45271/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:478086/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:489751/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:51790/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:549725/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:664224/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:6681/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:718205/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:736524/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:392852/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:814194/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:820268/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:857660/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:858404/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:873404/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:929100/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:940853/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:94703/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:947674/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:959544/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:97166/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:998673/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:183349/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1061423/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1064633/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1102092/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1282095/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:130279/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1350729/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1350735/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1363979/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1367731/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1457642/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1476105/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:148113/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1484656/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:1047806/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:188021/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:211784/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:218569/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:260899/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:2724/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:307245/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:307280/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:31029/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:311368/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:32528/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:332302/1‑66 (MQ=255) tCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTaa  >  1:361674/1‑66 (MQ=255)                                                                  | TCACCCCGAGCGAATAAACCACGCCGCCTACCGCCAGTAAGGTAACGCTGCCCGCCGCGAGCTTAA  >  minE/1941870‑1941935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑