Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1955744	1955843	100	43 [0]	[0] 48	ygfA	predicted ligase

ATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCC  >  minE/1955697‑1955743                                               | atatCTTCCAGTTTTTCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1099340/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:747386/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:368786/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:389781/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:495824/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:605595/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:611831/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:65035/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:669839/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:697992/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:717556/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:73120/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:343724/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:79349/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:805752/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:809592/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:816329/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:824011/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:8710/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:881639/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:900581/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:974130/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1334508/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1066042/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:115057/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1158917/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1161661/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:119591/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1207766/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1225132/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1290029/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1297825/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1325596/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1003915/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1357775/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1415641/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1443304/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1472091/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1514184/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:1518913/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:184457/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:27384/1‑47 (MQ=255) atatCTTCCAGTTTTGCATCCCATTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc  >  1:371425/1‑47 (MQ=255)                                               | ATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCC  >  minE/1955697‑1955743

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑