Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1963544	1963892	349	26 [0]	[0] 40	yggD	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

TAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTA  >  minE/1963501‑1963543                                           | tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:544578/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:997653/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:905911/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:898415/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:860752/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:823948/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:775070/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:76963/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:729735/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:631296/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:624693/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:598009/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:591503/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:1105666/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:51136/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:411509/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:384416/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:37593/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:285908/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:188472/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:184019/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:1529348/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:1507459/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:141637/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:1228304/1‑43 (MQ=255) tAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTa  >  1:1119615/1‑43 (MQ=255)                                           | TAATTCAATTTTCACGGCGTTAATTCCTTTAAGGTGGTCGTTA  >  minE/1963501‑1963543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑