Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1985854	1985905	52	85 [0]	[0] 145	yggM	conserved hypothetical protein

GAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCG  >  minE/1985783‑1985853                                                                       | gAAATCTCGTTTCTGCTTAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:266254/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCAGTTCATATCACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:838040/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:690088/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:698500/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:661938/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:609144/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:593880/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:545556/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:513500/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:51173/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:51163/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:491346/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:449090/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:398879/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:384478/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:355910/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:332217/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:297200/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:294308/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:280851/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:272633/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:876246/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1001763/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:977295/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:974842/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:967494/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:930840/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:929745/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:90092/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:882834/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:876545/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:692513/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:853697/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:796490/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:781801/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:767870/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:76654/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:733888/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:718350/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:708424/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:991005/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1236746/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1390998/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:26111/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:137630/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1370805/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1369270/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1364771/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1344735/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1326077/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1307130/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1251436/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:137912/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1172383/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1171760/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1151479/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:114847/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1131495/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1130191/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1088728/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1075216/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1013153/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:165440/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:258538/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:25823/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:219277/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:218908/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:193954/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:192456/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:182908/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:168300/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1412153/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1551286/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1549029/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:152019/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1504174/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1441868/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1438946/71‑1 (MQ=255) gAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1413790/71‑1 (MQ=255)  aaaTCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:341507/70‑1 (MQ=255)  aaaTCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1506001/70‑1 (MQ=255)  aaaTCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1124368/70‑1 (MQ=255)  aaaTCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:1120664/70‑1 (MQ=255)  aaaTCTCGGTTCTGCGGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCg  <  1:753299/70‑1 (MQ=255)                 tgAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCTCAATCGCCg  <  1:472408/55‑1 (MQ=255)                                                                       | GAAATCTCGTTTCTGCTGAATCGGCACTTCATAACACTCTTCACTCTGTTTATGACATGCCGCAATCGCCG  >  minE/1985783‑1985853

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑