Missing coverage evidence...
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TTACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCG  >  minE/2004872‑2004941                                                                      | ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:586509/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1033799/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:192518/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:195421/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:225798/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:298899/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:372771/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:466875/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:475146/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:4988/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1555544/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:60772/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:657696/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:704286/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:743101/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:806327/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:869769/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:947985/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:97633/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1336489/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1080182/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1100828/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1143774/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1222779/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1236714/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1326842/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1328326/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1547635/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:135275/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1362469/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1429890/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1450694/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1522493/70‑1 (MQ=255) ttACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1532075/70‑1 (MQ=255)     tGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1220125/66‑1 (MQ=255)          gtcggGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:260699/61‑1 (MQ=255)              ggAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1424677/57‑1 (MQ=255)                      ggCACGCGCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGGCAGCCATTCCg  <  1:763958/49‑1 (MQ=39)                        cACTCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1130674/47‑1 (MQ=255)                             tCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCg  <  1:1356355/42‑1 (MQ=255)                                                                      | TTACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCAGGTAGTTCACCGCACCTTTACCGCGTGTCAGCCATTCCG  >  minE/2004872‑2004941

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑