Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	138665	139990	1326	41 [0]	[0] 19	htrE	predicted outer membrane usher protein

AAAATGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATG  >  minE/138594‑138664                                                                       | aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:644053/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:221089/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:363247/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:397552/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:403351/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:439971/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:448660/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:455833/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:477221/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:51535/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:205535/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:6520/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:71587/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:727765/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:745888/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:748255/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:780547/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:809205/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:911445/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:99642/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:202067/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1060539/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1067678/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1152110/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1162575/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1174437/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1252946/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1282845/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1313377/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:131471/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1342502/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1345699/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:134896/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1354295/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1363038/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1371966/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1389885/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:185679/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1045937/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAATCTTTTTGCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:616933/1‑71 (MQ=255) aaaaTGAACCGTAAGCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  >  1:1453427/1‑71 (MQ=255)                                                                       | AAAATGAACCGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATG  >  minE/138594‑138664

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑