Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2176643 2176976 334 80 [0] [0] 36 arcB hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ArcA

AACGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTG  >  minE/2176572‑2176642
                                                                      |
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGAGGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTTAAGCTTTGCCCTg  <  1:660002/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGTATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1025008/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:751828/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:416971/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:724814/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:705627/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:685909/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:685857/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:673930/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:672917/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:659596/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:658797/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:595750/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:558821/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:556627/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:518015/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:422828/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:420921/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:998157/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:873312/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1013703/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:983333/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:979204/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:955197/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:927876/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:917793/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:906537/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:900493/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:757050/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:872164/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:857657/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:833888/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:829872/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:827810/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:814651/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:770734/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:770281/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1206251/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:380824/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1473486/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1466362/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1453738/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1429091/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1317166/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1274410/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1215281/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1208478/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1482144/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1195687/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1193873/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1140991/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1130120/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1098357/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1050429/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1037614/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1034518/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:300782/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:367399/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:35073/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:332540/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1518432/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:294864/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:271626/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:256085/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:204007/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:185775/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:185691/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1544562/71‑1 (MQ=255)
aaCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:153924/71‑1 (MQ=255)
 aCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:527583/70‑1 (MQ=255)
 aCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1541990/70‑1 (MQ=255)
 aCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1108702/70‑1 (MQ=255)
 aCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:422789/70‑1 (MQ=255)
 aCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:981392/70‑1 (MQ=255)
 aCGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:352533/70‑1 (MQ=255)
        atcGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:726494/63‑1 (MQ=255)
          cGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:882259/61‑1 (MQ=255)
          cGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:932432/61‑1 (MQ=255)
             ccTCTTCTGCTCCCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:534686/58‑1 (MQ=255)
                   ctGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTg  <  1:1557660/52‑1 (MQ=255)
                                                                      |
AACGCATCATCGACCTCTTCTGCTACCGACGGTGCGTGGATCGTCAACGTAAAGGTTGAACCTTTGCCCTG  >  minE/2176572‑2176642

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: