Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2218106	2218373	268	65 [0]	[0] 99	yhdA	conserved inner membrane protein

TAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCGG  >  minE/2218049‑2218105                                                         | tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:709821/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:231603/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:240787/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1021336/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:247357/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:254956/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:263443/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:307997/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:413202/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:428312/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:435506/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:437404/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:456410/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:460597/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:534940/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:244993/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:710948/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:724820/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:784002/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:785024/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:794477/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:803196/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:805103/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:807857/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:829561/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:887150/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:905629/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:948125/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:998876/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:127061/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1135710/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1136806/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1128136/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1158832/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1121332/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1173397/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1225509/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:208729/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1253898/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1105365/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1257593/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1265653/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1103947/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1433818/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1470980/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1079801/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1494739/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1508796/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1511230/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1511700/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1058907/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:103086/57‑1 (MQ=255) tAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:206371/57‑1 (MQ=255) tAGATGGATCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:861989/57‑1 (MQ=255)  aGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:54025/56‑1 (MQ=255)  aGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1146285/56‑1 (MQ=255)  aGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:716572/56‑1 (MQ=255)  aGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:501641/56‑1 (MQ=255)  aGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:419606/56‑1 (MQ=255)  aGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:394884/56‑1 (MQ=255)  aGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:184101/56‑1 (MQ=255)      ggTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1024112/52‑1 (MQ=255)        ttCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:1353467/50‑1 (MQ=255)            cAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:844294/46‑1 (MQ=255)                     agagCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCgg  <  1:204682/37‑1 (MQ=255)                                                         | TAGATGGTTCCCAACACATTAGAGCCACGCTCACCGTTTAAGATACGAGTAGCCCGG  >  minE/2218049‑2218105

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑