Missing coverage evidence...
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TTACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGC  >  minE/2228386‑2228456                                                                       | ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:1038841/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:112188/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:1496070/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:188163/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:325389/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:451743/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:598338/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:658594/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:692798/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:777912/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:857443/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:926847/71‑1 (MQ=255) ttACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:993263/71‑1 (MQ=255)  tACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCagcagc  <  1:30378/70‑1 (MQ=255)                                                                       | TTACCTAGAGCGGGTGAGAATTGCCGAACATGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGC  >  minE/2228386‑2228456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑