Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2260503	2260503	1	59 [0]	[0] 69	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

CAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGT  >  minE/2260432‑2260502                                                                       | cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:647558/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:351321/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:417528/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:435215/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:437199/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:446344/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:474180/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:485471/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:528684/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:541493/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:577624/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:587751/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:602447/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:614703/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:645681/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1028403/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:649266/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:653018/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:66652/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:721166/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:743376/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:80435/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:824171/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:826001/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:844806/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:933515/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:952337/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:963622/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:980344/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:33784/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1003775/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:109471/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1095316/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1133852/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1154622/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1159015/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1161968/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1175597/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1189210/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1227351/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1261516/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1403480/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1420008/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:147056/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:150010/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1534915/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:1535901/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:158003/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:249943/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:257611/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:265821/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:280354/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:297826/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:315707/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:322384/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:328818/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:343037/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCACTGTGGTGTAGt  >  1:999573/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATCACGGATTTAAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGt  >  1:457919/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CAGCTTGTTATCACGGATTTCAAAGATAACTTTTTCAAAGAACAGGTCGAGGATCTGCTCTGTGGTGTAGT  >  minE/2260432‑2260502

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑