Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	165506	165648	143	67 [0]	[0] 47	glnD	uridylyltransferase

TTGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCCTCT  >  minE/165439‑165505                                                                   | tttaTTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:287299/64‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTTTGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1382769/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:59270/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:67710/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:59183/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:548150/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:541491/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:540157/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:516053/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:449876/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:422634/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:396582/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:388205/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:387176/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:374548/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:30029/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:103113/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:654360/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:28736/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:685149/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:698621/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:733133/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:735800/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:768439/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:776782/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:884309/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:888015/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:918250/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:91871/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:930993/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:973293/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:985729/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:995492/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1309038/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:278720/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1421459/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1420265/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1410268/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1363894/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1354759/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1334265/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:132798/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1436328/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1297971/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1276763/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1267901/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1244562/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1114302/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1100256/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:106531/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1465737/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:255808/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:207922/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:206141/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:180626/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:172012/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:172001/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1545964/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1522281/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1520402/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1509116/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1489383/67‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:1450226/67‑1 (MQ=255)  tGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:585572/66‑1 (MQ=255)                gCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:475012/52‑1 (MQ=255)                     cAAAATAGTTAGCACGACTGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:474874/47‑1 (MQ=255)                        aaTAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCctct  <  1:847300/44‑1 (MQ=255)                                                                   | TTGATTTGGGCTATGGCGGACAAAATAGTTAGCACGACAGCGTGACCAAATTTGGTGCAGCGCCTCT  >  minE/165439‑165505

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑