Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2423886	2424119	234	75 [0]	[0] 73	[rffC]	[rffC]

CACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGC  >  minE/2423816‑2423885                                                                      | cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:486039/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:678845/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:677318/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:65918/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:637915/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:59121/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:577264/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:569748/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:517684/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:51667/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:688426/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:485374/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:484588/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:473111/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:467360/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:465278/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:462623/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:432315/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:399571/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:803673/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:99164/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:94765/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:94632/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:937944/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:937820/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:917193/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:887191/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:827665/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:371297/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:792143/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:790309/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:787961/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:754770/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:747424/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:740591/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:721501/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:690005/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1082798/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1187167/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:100083/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1137661/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1124186/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1121864/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1116554/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1101260/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1084962/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1144341/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1073901/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1072084/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1069744/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1049350/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1031731/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1019540/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1002504/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1001042/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1446822/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:366517/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:332069/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:309635/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:308020/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:305932/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:277749/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1539122/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1197064/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1383922/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1382175/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1377739/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1344697/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1335651/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1267491/70‑1 (MQ=255) cACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:121168/70‑1 (MQ=255)  aCGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1275204/69‑1 (MQ=255)          ggCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1017692/61‑1 (MQ=255)            cTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:704442/59‑1 (MQ=255)                            cgcTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGc  <  1:1009426/43‑1 (MQ=255)                                                                      | CACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGGCTAACTGACGTAATGCGGGAATATCGGTCTCTTGTGC  >  minE/2423816‑2423885

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑