Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | minE | 2446972 | 2447163 | 192 | 85 [0] | [0] 57 | ilvG | Mutation in protein compared to W3110: p.Glu327_Ilefs*223 Restoration of IlvG found in MG1655 (548 amino acids), fusion of N‑ter and C‑ter fragments ECK3760:JW3740+JW3741:b4488; large subunit of acetolactate synthase II |
TGCTGCGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTG > minE/2446902‑2446971 | tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTTGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:571739/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:371266/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:542826/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:510891/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:499263/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:498447/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:427709/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:405074/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:396414/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:394195/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:381876/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:575127/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:37079/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:363336/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:340109/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:292600/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:29028/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:284380/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:281530/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:279405/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:10261/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:783090/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:99752/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:994743/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:909573/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:856482/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:85353/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:819328/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:817526/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:807633/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:801255/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:79689/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:260720/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:767211/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:755925/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:690276/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:670423/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:658549/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:637488/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:633966/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:584384/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:583429/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1123896/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1356234/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1355087/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1345876/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1338634/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1306391/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1291363/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1227771/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1187981/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1167492/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1165169/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1366549/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1113564/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1109522/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1107821/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1071498/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1054000/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1049862/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:10396/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1032929/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1030303/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1451107/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:237082/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:177084/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:168961/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1525510/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1520267/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1516112/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1511115/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1492583/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1454162/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:25688/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1443411/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1427987/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1423855/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1420723/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1412945/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1383174/70‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGATTACGATCTg < 1:1394043/70‑1 (MQ=255) gctgcGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1056674/69‑1 (MQ=255) tgcCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGG‑TTACGATCTg < 1:43004/45‑1 (MQ=255) cTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:1439395/36‑1 (MQ=255) cTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTg < 1:456455/36‑1 (MQ=255) | TGCTGCGCAGCCCACATCTGGTGCTGCCCCACATCTGTGGTCACGACGCAATCCGCAGGTTTACGATCTG > minE/2446902‑2446971 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |