Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2501638	2502016	379	16 [0]	[0] 85	uhpC	membrane protein regulates uhpT expression

CGCGTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGAA  >  minE/2501574‑2501637                                                                | cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:1096028/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:1245080/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:1314253/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:1394155/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:1415723/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:1536073/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:1536916/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:285236/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:621302/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:771926/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:819463/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:845460/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:876976/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:959364/64‑1 (MQ=255) cgcgTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:997139/64‑1 (MQ=255)                        cAACGGTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGaa  <  1:283262/41‑1 (MQ=255)                                                                | CGCGTGTCAGCGTTTCTCTACCTCAACGCTATGTCTAAGGTTTGATGATGTTGCCGTTTCTGAA  >  minE/2501574‑2501637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑