Missing coverage evidence...
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TTCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCATT  >  minE/176592‑176660                                                                     | ttCCTTGCGATCTAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:555980/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:666343/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:425897/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:431939/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:453516/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:481375/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:48329/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:4863/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:521867/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:637731/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:654720/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:423618/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:728566/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:735625/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:762841/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:768819/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:805961/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:806067/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:826233/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:84112/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:957911/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:989490/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1463146/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1143244/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1165206/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1179599/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1195267/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1281145/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1316249/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1333176/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:329265/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1475680/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1483024/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1489309/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1516372/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:165413/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:180368/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:192025/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:249876/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:275347/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:306671/69‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTGCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:914615/69‑1 (MQ=255)  tCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:718315/68‑1 (MQ=255)    cTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTCTCGCAtt  <  1:1119585/66‑1 (MQ=255)     ttGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1297306/65‑1 (MQ=255)                        gggCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1336458/46‑1 (MQ=255)                                cGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCAtt  <  1:1235225/38‑1 (MQ=255)                                                                     | TTCCTTGCGATCGAAAAGATCAAGGGCGGACCGGTATCCGAGCGGGTTCAAGACTTTTGTTATCGCATT  >  minE/176592‑176660

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑