Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2517221	2517368	148	51 [0]	[0] 82	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

AACATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCTTT  >  minE/2517174‑2517220                                               | aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:74586/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:322655/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1009491/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:344287/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:388251/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:509006/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:550411/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:560595/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:627124/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:659618/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:67471/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:67561/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:327938/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:754704/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:76796/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:793967/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:797837/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:89939/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:900134/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:924316/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:931000/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:993105/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:994805/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1263434/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1016168/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1049260/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1126402/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:113658/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1137272/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1229611/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1239323/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1244907/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:280397/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1303544/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:256952/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1354335/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1431979/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1438282/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1516996/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1518968/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1343293/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1520365/47‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:232822/47‑1 (MQ=255)  aCATCTCCACCTTGATTTCGGTTATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:242785/46‑1 (MQ=255)  aCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATTAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:1535222/46‑1 (MQ=255)  aCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:886562/46‑1 (MQ=255)  aCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:109321/46‑1 (MQ=255)  aCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:67931/46‑1 (MQ=255)  aCATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCCTCTCttt  <  1:940317/46‑1 (MQ=255)           ccTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:830260/37‑1 (MQ=255)            cTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCttt  <  1:902694/36‑1 (MQ=255)                                               | AACATCTCCACCTTGATTTCGGTGATGAACTCCTGCGCCGTCTCTTT  >  minE/2517174‑2517220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑